3,3V oder 5V dürfte ziemlich egal sein. Wichtiger ist, wie sauber die Spannung ist. Da die 3,3V meist über Linearregler erzeugt werden, die 5V dagegen häufig aus Schaltreglern, gibt es mit den 3,3V vielleicht tatsächlich weniger Probleme, aber einfach nur, weil dann der Schaltregler schlecht implementiert ist.