Vielleicht hilft es euch: Ich habe nur dann Probleme mitm CLI, wenn ich per XBee oder BT dranhänge. Per USB gehts immer, auch wenn man wirres Zeug sieht, einfach Enter drücken.
Sieht man nur den MAVLink Code, ist meist eine XBee Verbindung oder was ähnliches am Start. Da geht die Konsole nicht.